楊正芳得到洪承疇的密令，率部先行，往商州而去。三日後，洪承疇的大軍向潼關開拔。
四月二十八日，洪承疇的大軍抵達潼關。當晚大軍駐紮後，洪承疇升帳，召各路領軍將領行轅議事。
燈火把洪承疇的行轅照得通明，洪承疇當中而坐，監軍張若騏和兵部尚書張翼鳳分坐左右，各路將領分兩排坐定。
洪承疇道：“如今賊寇竄回陝南，其氣焰十分囂張。據報，高迎祥、李自成、張獻忠、高峻山等賊首已聚集於涇陽、臨潼、藍田一帶，不下三十萬眾，明日我軍就要與之交戰，諸位將軍可有良策？”
“嘿嘿，洪軍制說笑了，”餘世任笑道：“我軍兵強馬壯，無堅不摧，區區賊寇，還用什麼良策？只要您一聲令下，我餘世任第一個殺出潼關，必殺它個片甲不留，死無全屍！”
洪承疇點頭讚道：“餘將軍素有威名，屢敗賊寇，英名遠振。我令你立即起兵攻擊藍田的張獻忠，然後與先期到達商州的楊正芳從山陽、鎮安、洵陽馳入漢中，我料定賊寇敗亡之後必逃漢中。”
“遵令！”餘世任在洪承疇面前拍著胸膛道，“我餘世任絕不辜負洪制軍的期望，一定先於賊寇到漢中！”
洪承疇撫著餘世任的肩頭關切道：“此次行程，道路遙遠難行，餘將軍你多多的辛苦啦！我將集關中兵馬與你會師漢中！”
餘世任感動萬分：“末將定不負洪制軍的厚愛！”
“好！”洪承疇滿面紅光，“諸將聽令，明日早飯後，進兵臨潼！”
……
洪承疇來到臨潼，追擊高迎祥、李自成，兩軍還沒開戰，其主力便向永壽逃竄，只留下沒有戰鬥力的老弱來抵禦官軍，洪承疇命令劉遷、夏鎬、唐通三員戰將出擊，洪承疇站一高坡處遙望戰場。
這隻能說是一場屠殺，雙方的實力對比十分的懸殊，洪承疇心中談不上喜悅，雖然他殺了這些人一樣可以去向那裡皇上請功，但是，不消滅高迎祥、李自成、張獻忠、高峻山這樣的賊王，他就沒有好日子過。
突然，西面一陣沙塵滾滾，一彪人馬殺入戰場，洪承疇遠遠望見是一支大明的官兵的裝束，提著的心頓時放了下來。
“前去打探一下，來的是那一路人馬！”洪承疇對身邊的親兵道。
“遵令！”
一盞茶的功夫，親兵回報，是駐守西安的孫傳庭前來參戰。
監軍張若騏道：“看來西安已經安全了，我們可以放心地向永壽追擊。”
洪承疇在地上攤開地圖，思索著，一陣風吹過，一片綠葉飄落在地圖上，他輕輕地將葉子撣開，捲起地圖對身邊的山海關總兵楊麒道：“楊總兵，請你的人馬立即向永壽追擊高迎祥、李自成，務必將其剿滅，不能再讓賊寇四處逃竄！”
“末將遵令！”
“好！”洪承疇擺擺手讓楊麒退下，然後對張若騏道：“張公公，我們去會一會孫傳庭。”
孫傳庭一見洪承疇就向他稟報了高迎祥、李自成圍攻西安的情況，由於孫傳庭守禦堅固，才使得賊寇的攻城計劃沒有得逞，轉而向永壽方向逃竄，他率部出城追擊，在此遇到洪承疇的主力。
洪承疇大喜，道：“孫將軍守西安有功，我要向皇上為孫將軍請功的。”
孫傳庭拜謝道：“承蒙洪軍制抬愛，傳庭感激不盡!”
接著，洪承疇、孫傳庭收攏兵馬，合兵一處，在西安城下安營紮寨，運籌下一步的追剿計劃。
第二日，洪承疇在行營之中，接到探馬來報，高迎祥、李自成攻陷永壽，永壽知縣薄匡宇戰死。憤怒的洪承疇把手中的茶杯摔碎在地，遷怒於楊麒。
他怒火未消，又有探馬來報，張獻忠在商州被楊正芳擊潰，逃至山陽，攻取豐陽關，遊擊周仕風領兵往照川堵截，被張獻忠所殺，張獻忠已經由水銀山進入漢中。
洪承疇派楊正芳、餘世任圍堵張獻忠的計劃落空。
探馬又報：高峻山逃竄至桐柏山，然後就不見蹤影。
洪承疇得到這些戰報，嘆息不已，如果這些賊寇聚合在一起，他倒不怕，現在被他這麼一追殺，賊寇東分西裂，憑洪承疇手中的兵馬，已經應接不暇，顧頭不能顧尾，他決定先解決陝西的問題，等剿滅了高迎祥、李自成、張獻忠再騰出手來對付高峻山。
又過了幾日，探馬來報，高迎祥、李自成分兵進攻鳳翔、平涼，洪承疇不得不再次分兵追擊。
卻說朱由檢在北京得到洪承疇在陝西剿匪的塘報，對洪承疇很是失望，他認為，光是陝西一省，洪承疇就弄到如此地步，再讓他兼管河南、山西等地的軍事，勢必難於成事。
匪患不除，朱由檢寢食難安。於是，他下詔書，讓洪承疇在西安固守陝西三邊，派湖廣巡撫盧象升，總理直隸、河南、山東、湖廣、四川軍務，還明確他們各自的職能：“洪承疇督剿西北，盧象升督剿東南。”