卷二十，氣交變大論篇第六十九，五常政大論篇第七十。
卷二十一，六元正經大論篇第七十一，刺法論篇第七十二(遺篇，本病論篇第七十三(遺篇。
卷二十二，至真要大論篇第七十四。
卷二十三，著至教論篇第七十五，示從容論篇第七十六，疏五過論篇第七十七，徵四失論篇第七十八。
卷二十四，陰陽類論篇第七十九，方盛衰論篇第八十，解精微論篇第八十一。
摺疊靈樞目錄
卷一、九針十二原第一，本輸第二，小針解第三，邪氣藏府病形第四。
卷二、根結第五，壽夭剛柔第六，官針第七，本神第八，終始第九。
六腑，即膽、胃、大腸、小腸、膀胱和三焦。
奇恆之腑也屬於腑，但又異於常。係指腦、髓、骨、脈、膽和女子胞。這裡邊膽即是大腑之一，又屬於奇恆之腑。
臟腑雖因形態功能之不同而有所分，但它們之間卻不是孤立的，而是相互合作、相互為用的。
經絡系統可以分經脈、絡脈和腧穴三部分。經脈有正經十二:手太陰肺經、手陽明大腸經、足陽明胃經、足太陰脾經、手少陰心經、手太陽小腸經、足太陽膀胱經、足少陰腎經、手厥陰心包經、手少陽三焦經、足少陽膽經、足厥陰肝經。十二經脈首尾相聯如環無端，經氣流行其中週而復始。另有別於正經的奇經八脈:督脈、任脈、衝脈、帶脈、陰蹺脈、陽蹺脈、陰維脈、陽維脈。(注:“奇經八脈“一名始於《難經·二十七難》
經脈之間相交通聯絡的稱絡脈。其小者為孫絡不計其數;其大者有十五，稱十五絡脈。《靈樞·經脈》敘述的非常詳細。
腧穴為經氣遊行出入之所，有如運輸，是以名之。《黃帝內經》言腧穴者，首見《素問·氣穴論》，再見於《素問·氣府論》，兩論皆言三百六十五穴。實際《氣穴論》載穴三百四十二，《氣府論》載穴三百八十六。
精氣神為人身三寶。精，包括精、血、津、液;氣，指宗氣、榮氣、衛氣;神，指神、魂、魄、意、志。精和氣是構成人體的基本物質，氣和神又是人體的複雜的功能，也可以認為氣為精之御，精為神之宅，神為精氣之用。
摺疊病機學說
研究疾病發生、發展、轉歸及變化等等之內在機理的學說稱病機學說。
《素問·至真要大論》所說“審察病機，無失氣宜“、“謹守病機，各司其屬“都是此學說的內容。
1.病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是後世三因說之濫觴。
2.發病:正邪雙方力量的對比，決定著疾病的發生與發展，這就是“正氣存內，邪不可幹“之意。《素問·上古天真論》所說“精神內守，病安從來“，《素問·評熱病論》所說“邪之所湊，其氣必虛“等，都論證了這一點。
3.病變:疾病的變化是複雜的，《黃帝內經》概括病變也是多方面的，有從陰陽來概括的，用表裡中外歸納的，用寒熱歸納的，從虛實而論者，實指邪氣盛，虛指正氣衰。概括說來，有正虛而邪實者，有邪實而正不虛者，有正虛而無實邪者，有正不虛而邪不實者。
摺疊診法學說
望聞問切四診源於《黃帝內經》。
1.望診:包括觀神色、察形態、辨舌苔。
觀神色者，如《靈樞·五色》、《靈樞·五閱五使》和《靈樞·五色》所載，這些在臨床上都很有意義。
察形態者，是察看人的骨肉面板而推斷病情，在臨床上虛實是錯綜複雜的，只有知其常，才能達其變。
辨舌苔者，如《素問·熱論》、《素問·刺熱論》和《靈樞》所載等等。
2.聞診:包括聞聲和嗅氣味。
聞聲音者，是聽患者的聲音而診斷病情。
其次是嗅氣味，如《素問·金匱真言論》所說，肝病其臭臊，心病其臭焦，脾病其臭香，肺病其臭腥，腎病其臭腐。
戰國時期
持這種觀點的人有宋代的邵雍、程顥、司馬光、朱熹，明代的桑悅、方以智、方孝孺，清代的魏荔彤等。其主要理由是:首先，將《黃帝內經·素問》與同樣是戰國時代的《周禮》相比較，有許多相同之處，足以充分證明兩書是同一時代、同一思想體系的作品;其次，《史記·扁鵲傳》中有關醫理的內容，與《黃帝內經·素問》的內容相類似，但卻樸素、原始得多，而《史記·倉公列傳》中有關醫理的內容卻比《黃帝內經·素問》有所進步，由此推斷:《黃帝內經》應當是扁鵲時代以後、倉公時代之前的作品，也就是戰國時代的作品。最後，以《黃帝內經》的文體為例，也可以說明這一點:先秦之文，多作韻語，而《素問》中韻語的文字特別多。
清代《四庫全書簡明目錄》進一步肯定了這一說法，因為《四庫全書》在中國古代學術界有相當高的地位，這種說法也就被許多人所接受。
西漢時期
明代郎瑛從夏禹時儀狄造酒的傳說和“羅“出現於漢代等證據推斷《素問》產生於西漢時期。
現代中醫學專家劉長林、吳文鼎等人也持這種意見。其主要理由是:其一，《黃帝內經》全書約計20萬字，這在2000多年前可以說是一部鉅著。編著這樣的醫籍需要有一個安定的社會環境，需要花費巨大的人力、物力，這在戰事連年、七雄割據的戰國時代是不可能辦到的。只有在西漢時期，隨著政治的穩定，經濟的發展，才為醫學家編著醫籍提供了現實的條件;其二，西漢初淮南王劉安的《淮南子·修務訓》曰:“世俗人多尊古而賤今，故為道者必記之神農、黃帝而後能入說。“《黃帝內經》在書名和思想內容上與“黃老學派“的密切聯絡，也為只有在西漢“黃老學派“鼎盛時期才能成書提供了佐證;其三，西漢司馬遷在《史記·倉公列傳》中，記述了西漢初年名醫淳于意在接受老師公乘陽慶傳授給他的十種醫書中，竟沒有《黃帝內經》，這也足以說明《黃帝內經》不可能成書於西漢之前。
以上觀點可以看出，古人認為《黃帝內經》成書為戰國時期較為可信。但也不能認為《素問》、《靈樞》所有篇章盡出戰國。元末明初醫學家呂復對此發表過中肯的見解，認為內經非一時之言，亦非一人之手。姚際恆《古今偽書考》、周木《素問糾略序》、程敏政《新安文獻集·運氣說》、黃省曾《五嶽山人集·內經注辨序》等人也贊同呂復。