病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是後世三因說之濫觴。
2.發病:正邪雙方力量的對比，決定著疾病的發生與發展，這就是“正氣存內，邪不可幹“之意。《素問·上古天真論》所說“精神內守，病安從來“，《素問·評熱病論》所說“邪之所湊，其氣必虛“等，都論證了這一點。
3.病變:疾病的變化是複雜的，《黃帝內經》概括病變也是多方面的，有從陰陽來概括的，用表裡中外歸納的，用寒熱歸納的，從虛實而論者，實指邪氣盛，虛指正氣衰。概括說來，有正虛而邪實者，有邪實而正不虛者，有正虛而無實邪者，有正不虛而邪不實者。
摺疊診法學說
望聞問切四診源於《黃帝內經》。
1.望診:包括觀神色、察形態、辨舌苔。
觀神色者，如《靈樞·五色》、《靈樞·五閱五使》和《靈樞·五色》所載，這些在臨床上都很有意義。
察形態者，是察看人的骨肉面板而推斷病情，在臨床上虛實是錯綜複雜的，只有知其常，才能達其變。
辨舌苔者，如《素問·熱論》、《素問·刺熱論》和《靈樞》所載等等。
2.聞診:包括聞聲和嗅氣味。
聞聲音者，是聽患者的聲音而診斷病情。
其次是嗅氣味，如《素問·金匱真言論》所說，肝病其臭臊，心病其臭焦，脾病其臭香，肺病其臭腥，腎病其臭腐。
3.問診:問訊患者的自覺症狀，以診斷病情。
4.切診:包括切脈與切膚。《黃帝內經》言切脈最詳，主要為:
 1三部九候法:即分頭手足三部，每部分天地人三候。
 2人迎寸口脈法:即兼診人迎和寸口兩處之脈，互相比較。
 3調息法:即調醫者之呼吸，診病人之脈候。
 4謂胃氣脈:脈象之中有無胃氣，至關重要，有胃氣則生，無胃氣則死。
 5六綱脈:《黃帝內經》所載脈象很多，如浮、沉、遲、數、虛、實、滑、澀、長、短、弦、細、微、濡、軟、弱、散、緩、牢、動、洪、伏、芤、革、促、結、代、大、小、急、堅、盛、躁、疾、搏、鉤、毛、石、營、喘等等。但常以六脈為綱加以概括。
其次是切膚:膚泛指全身肌膚，按肌膚而協助診斷的內容很多，如“按而循之“、“按而彈之“等等。但論之最詳細的是切尺膚。因為脈象與尺膚有必然的聯絡，故診病時亦可互相配合。
摺疊治則學說