海洋，這個星球上最為廣闊、最為宏偉的世界。它覆蓋了地球約70%的表面積，即使是最巨大的吼鯨王，在海洋中都渺小得彷彿塵埃。然而，這裡也是人類最少涉足的地方，有95%的海底尚未被先行者踏足，我們對遠洋深海的瞭解甚至比月球更少。它神秘、瑰麗，孕育著遠超陸地生物的數量，無數神秘的寶可夢居住其中，日夜上演著繽紛絢爛的生命樂章。
生物在海洋中並不是平均分佈的。溫暖的陽光與富含營養的洋流吸引著寶可夢們，越是靠近海岸線，生命也就越活躍。熱帶地區的溫暖海水擁有最豐富多彩的生物群落，如果你從關都地區向南出發，乘船駛向廣袤的中極洋，便會見到一片五彩斑斕的絕美海域。
·珊瑚礁
溫暖的熱帶淺灘是太陽珊瑚最愛的聚居地。生活在潔淨海水中的太陽珊瑚能夠長出鮮豔枝條，在陽光下發出七彩光芒，彷彿海中星辰般攝人心魄。
眾所周知，太陽珊瑚頭部的枝條會不斷生長，脫落下來的珊瑚枝色澤美麗，自古以來都是受人歡迎的飾品材料，吸引著漁民前去打撈。而在中極洋的橘子群島一帶，太陽珊瑚族群會尋找心儀的棲息地，並將掉落的珊瑚枝埋入沙土之中。它們強大的自我再生能力使珊瑚枝即便脫離本體也能緩慢生長，在溫度適宜、養分充足的海域，珊瑚枝每年至少增長15厘米，其生命甚至能持續千百年之久，形成的珊瑚礁綿延千里，成為支撐南方海國人們生活的大地，亦孕育了獨一無二的生態群落。
野生的太陽珊瑚多以海藻為食。它們個頭矮小，消耗能量不多，無需頻繁外出覓食，大多時候都躲藏在茂密的珊瑚枝間休憩——而這裡同樣也是小型魚寶可夢的庇護所。愛心魚族群與太陽珊瑚伴生，世代棲息在珊瑚礁；弱丁魚們也將此視作庇護所，以躲開大型掠食者的襲擊。
然而，即使是在安寧的淺灘，它們依舊要面對生存的挑戰。擁有蝶翼般美麗魚尾的寶可夢，熒光魚群造訪了這片珊瑚礁。
與它們的進化型不同，熒光魚並非完全的深海生物。它們白天會成群結隊來到陽光充沛的淺灘，透過身上花紋汲取陽光的能量，夜晚再向深海移動。對於它們而言，珊瑚礁往往意味著一頓饕餮盛宴——密集的珊瑚枝將大個頭拒之門外，卻無法阻攔同樣較小的熒光魚。它們身手敏捷，擅長捕獵，弱丁魚毫無勝算，只能縮在角落瑟瑟發抖，祈禱自己不要被盯上。
在無風無浪的午後，珊瑚礁迎來了一群不速之客。
好壞星——太陽珊瑚的天敵，也是珊瑚礁生態的頭號破壞者。它們喜食太陽珊瑚的枝條，在好壞星大量繁殖的海域，連生長百年的美麗珊瑚礁都會被啃食殆盡，只留下被毒液侵蝕後白化的殘骸。它們的尖刺能輕易刺穿太陽珊瑚的面板，用毒使它們全身麻痺後拖回巢穴慢慢享用。棲息在海灘的啪擦海膽也是好壞星們的襲擊物件，膽小的啪擦海膽鮮少與天敵爭鬥，第一時間落荒而逃，只留下滿地斷裂的尖刺，成了好壞星最愛的餐後甜品。
當太陽珊瑚們驚慌失措時，好心的鄰居往往會仗義出手。
棲息在珊瑚礁的大鉗蟹和巨鉗蟹們有充足的與好壞星戰鬥的經驗。強有力的鉗子能將好壞星整個掀翻，攻擊它們柔軟的身軀。除此之外，磨牙彩皮魚有時也會伸出援手。它們結實的面板能抵抗好壞星的尖刺，一口鋒利獠牙足以將刺咬碎吃下去。有超壞星帶領的群體偶爾會與磨牙彩皮魚發生激烈爭鬥，但勝者寥寥。
與單打獨鬥的磨牙彩皮魚不同，淺海區另一位重量級掠食者，刺梭魚和戽斗尖梭習慣於群體行動。如今正值盛夏，弱丁魚群常出沒於珊瑚礁附近，也正是梭魚們捕獵的最好時機。
弱丁魚是海洋中最弱小的寶可夢。它們擅長群體行動，藉助眼睛發出的光心念相通，組成巨大的陣型抵禦外敵。襲擊弱丁魚群是個技術活——掠食者必須耐心謹慎，一點點將它們分散、削弱、逼入絕境，才能安穩享用這頓盛宴。若是胡亂攻擊魚群，陷入恐慌的弱丁魚偶爾會聚整合一種恐怖的、被稱作“海之魔物”形態，即使是強大的暴鯉龍都會被這樣的魚群吞噬殆盡。
而刺梭魚和戽斗尖梭們正精通此道。它們依靠出類拔萃的游泳速度從下方發起進攻，逼迫魚群不斷向上移動。一旦被驅趕到礁石以上的淺海，狹小的空間不足以令魚群大規模聚集，弱丁魚只能四散奔逃，成為捕獵者的盤中餐。不消一刻，魚群便被瓜分殆盡，只剩殘破的銀色魚鱗散落在礁石上，變成太陽珊瑚和大鉗蟹的飯後零食。
生長多年的珊瑚枝根系粗壯，內部中空，錯綜複雜的枝條盤踞在礁石上，漸漸在其中形成了海綿網路似的管道。在這樣不起眼的角落也有捕食者潛伏——麻麻小魚正是其中佼佼者。它們能靈敏感應到四面八方傳來的電訊號，輕易尋找到迷路的弱丁魚，用電擊讓它們無法動彈，只能束手就擒。
不同的寶可夢往往擁有不同的捕獵技巧。白色條紋的野蠻鱸魚喜歡若無其事地混入愛心魚群，直到原住民習慣了它的存在後再突然發動襲擊；居住在泥沙底部的泥巴魚則是伏擊型寶可夢，會盯準踏入它地盤的外來者，冷不丁放電來麻痺對方。而紅色與藍色條紋的野蠻鱸魚帶來的則是另一種麻煩，它們之間勢如水火，一旦相遇必定引發一場轟轟烈烈的地盤之爭。倒黴的小魚們只好躲進珊瑚枝之間，藉此暫避風頭。偶爾，野蠻鱸魚們的爭鬥太過激烈，也會吸引來天敵下石鳥——這些猛禽擁有修長的鳥喙，能在紛亂的海浪中輕而易舉將魚寶可夢叼走。
夜幕降臨。魚群早早地躲藏起來休息，而另一種寶可夢的捕食時間終於到了。
麻麻鰻，它們沿著海床緩慢行進，釋放出的微弱電場能夠感應到隱藏在沙子下的生物蹤跡。那隻可憐的大舌貝正在熟睡，驟然遭遇電擊，根本來不及反抗便失去了意識。鰻魚吸盤形狀的大嘴能輕易將貝殼撬開，吃到柔軟的貝肉；在這座海灘，它的捕獵行動幾乎無往不利。
但它並非珊瑚海夜晚最強的掠食者。
巨牙鯊來了。
被稱為大海惡霸的巨牙鯊在近海區幾乎所向無敵。珊瑚枝並不會成為它們的阻礙，那口連鐵板都能刺穿的獠牙會輕易咬斷枝條，將躲藏在其中的魚寶可夢啃食殆盡，即使是兇惡的野蠻鱸魚都不敢與鯊魚群爭鋒。
幸好，巨牙鯊並不是這一帶的常駐民，僅僅是跟隨洋流路過，想必明天便會不見蹤影。在絕大多數時候，珊瑚枝依舊是小魚們安全的庇護所。
每到春夏時節，大量的弱丁魚便會聚集在珊瑚海，進入一年一度的繁衍期。對於平均體長只有0.2m的弱丁魚而言，像大型寶可夢那樣生蛋孵化是幾乎無法承受的負擔。但小傢伙自然也有小傢伙的生存之道。
日色西沉，雌性弱丁魚開始活躍起來。它們在珊瑚枝之間選定心儀的位置，開始產出半透明的魚卵，雄性則爭相為魚卵受精。在接下來的幾天內，受精的魚卵吸收淺海豐富的營養物質，漸漸發育膨脹，長出不透明的硬殼，變為我們熟悉的寶可夢蛋的模樣；而再過一週，它們將會孵化出魚苗，在一個無風無浪的白天一同啟程，前往大海深處遨遊。
對於捕食者們而言，弱丁魚的魚卵是營養價值極高的美餐。一夜過去，雪白的卵幾乎將珊瑚礁掩埋，它們很快便會被瓜分搶食，能存留下來的不足十之一二。但儘管如此，龐大的數量也使得弱丁魚無需為繁衍苦惱，成為種族生存一道當之無愧的王者。
在熱帶的淺灘中，還有一種相貌猙獰的寶可夢與太陽珊瑚相伴生存——海刺龍。它棲息在珊瑚枝深處，用背上有毒的刺作為防身武器，每年都有采珊瑚的漁民不慎被它刺傷。
海刺龍的繁衍方式也與眾不同。伴侶雙方各有領地，不會居住在一起；每天清晨，雌性海刺龍前往伴侶的領地拜訪，不光攜手捕獵，還會一同跳舞歡歌增進感情。負責撫養後代的公海刺龍將蛋貼在腹部，寸步不離地照顧——與弱丁魚不同，墨海馬的蛋需要經歷漫長的幾十天才能孵化。
但比起拉普拉斯，這段時間則顯得短暫了許多。
每年晚春，拉普拉斯們都會回到它們出生長大的海域。產下卵的拉普拉斯不會再出海遠行，和它的伴侶一同留在珊瑚礁生活。即使在水溫最高的赤道附近，它們的蛋也需要至少一年的時間孵化，而小拉普拉斯學會游泳和捕獵，能夠跟隨父母遠行則要再花數月時間。儘管如此，離群多年的拉普拉斯依舊能輕易尋找到它的族群——在相隔千里的廣袤海洋，它們究竟是如何溝通、又如何找尋彼此，這至今都是一個謎團。
盛夏，暴風雨來臨，珊瑚礁面臨著史無前例的危機。
大自然擁有著任何寶可夢都無法匹敵的力量。颶風帶來的大浪能輕易折斷珊瑚枝，將礁石整個撕裂開來。每當雨季到來，敏銳的海刺龍率先動身，太陽珊瑚群則緊隨其後，帶領著小型寶可夢們浩浩蕩蕩遊向深海，躲避即將到來的災難。
它們的生存戰略是正確的——風浪過後，最靠近淺灘的珊瑚礁已經被徹底摧毀，無數枝條被生生折斷，散落在海底各處，原本美麗的風景蕩然無存，只留下一片狼藉廢墟。即使是生長千年的巨大礁石都可能在暴風雨中被毀於一旦。
但這並不意味著結束。雨季過去，風浪落幕，太陽珊瑚們還會回到原本的住處，再次種下枝條，等待它們生長。直到百年以後，這裡又將是一片瑰麗的珊瑚海。
·深海
在我們居住的這顆藍色星球，有60%的面積被超過一公里深的大海覆蓋。這裡生活著平日難以見到的怪異生物，和千奇百態的寶可夢群落。
不同於陽光明媚的淺灘，海洋深處是個冰冷又昏暗的世界。