伊恩和綾波麗一起進入了莉莉絲的裡面，莉莉絲的身體中包含著無數的生命訊息。
伊恩看到了黑之月降臨到地球的場景。
那是生命的誕生，黑之月撞擊到地球的表面，緩緩沉下。
無窮無盡的生命之水從黑之月中湧動出來，然後，生命誕生了。
植物、動物、人類.生命自莉莉絲誕生，佔據了這顆星球上的土地，野蠻生長。
這便是第一次衝擊。
而先於莉莉絲墜落到地球的亞當和白之月，卻因為朗基努斯之槍的限制而失去了孕育“使徒”能力。
在同一顆星球上，本來只能有一顆“月”來孕育生命，但錯誤的發生，使得自亞當誕生的生命，即使徒，開始尋求淨化。
擁有生命之果的使徒是完整的個體，不需要繁殖，也不需要向外界汲取能量，但是它們缺乏智慧，而擁有智慧之果的人類是莉莉絲的後代，富有智慧但是沒有單一的個體，生命短暫。
創造了黑之月和白之月的“神”，不允許生命之果和智慧之果同時出現在同一個個體上，不允許與“神”同等存在的生命誕生，所以設定了“朗基努斯之槍”這一限制。
而SEELE，他們想做的事情，就是打破這個限制。
他們要讓所有人類，所有自莉莉絲誕生的生命，迴歸伊甸園，迴歸到人類的母親莉莉絲之中。
AT力場，心之壁，就是這個東西，讓人類從完整的一分裂成了無數的個體。
只要消除AT力場，人類的意識就會重新回於全。
SEELE渴求的進化，是消除人類個人的意志，消除人與人之間的隔閡，所有人將回到完整的世界，所有的人，將成為新誕生的“神”，即便月亮、太陽和地球有一天消失，“神”也能永恆地存在下去。
這就是人類補完計劃的最終目的。
為此，SEELE要清除亞當的使徒，要讓莉莉絲吞噬亞當。
當補完計劃完成，人與人的心靈之間，就不再存在心之壁，每一個人都能做到互相理解，因為他們已經成為了一個整體。
當初號機與莉莉絲接觸，那麼真正的“神”便誕生了，屆時就是人類補完計劃的完成。
乍一聽，似乎是很完美的計劃。
但其實只是SEELE自己心中的完美，他們完全沒有考慮過其他人類，沒有考慮過在第二次衝擊失去的人，沒有考慮過不願意接受的人，他們傲慢而自大，僅僅數人就要決定全人類的命運。
身處儀式中心的碇真嗣，正在與許多人的靈魂融合。
反AT力場，從初號機身上爆發。
莉莉絲從最終教條區起身，一個突破天際的巨人，用雙手籠罩了初號機。
此刻，莉莉絲終於凝聚出物質性的實體。
只要是這個世界誕生的人類，都無法阻止儀式的進行。
但是，伊恩，他本就是沒有AT力場的艾爾迪亞人。
所以SEELE稱呼他為異端，想盡心思要把他給處決。
伊恩與莉莉絲一同抵達了高空，他無法和莉莉絲融為一體。
在莉莉絲變成實體的那一刻，綾波麗將他送到了最上方，送到了莉莉絲的肩膀上。
他是SEELE計劃之外的，唯一的變數。
“不能讓異端接觸到朗基努斯之槍，那是阻止第三次衝擊的唯一的道具。”