初號機和剛剛抵達二號機緊隨其後，EVA的力場，將山包上的樹木震飛，腳下的大地崩裂。
而在天空之中，伊恩攜帶著S2機關，朝著空天使撞擊而去。
指揮室內，MAGI發出了刺耳的警報聲。
紅色的燈光閃爍，MAGI檢測到了足以毀滅基地的威脅，但並非是空天使，空天使早先就在它的監控之中了。
“這個能量反應，他用AT力場把空天使整個包裹起來了嗎，怎麼可能！”赤木律子愣愣地注視著MAGI監測到的畫面。
她繼承了母親的研究，幾乎將自己的整個人生都投入進了“E計劃”之中。
然而她無法解釋當前發生的一切，她無法理解那個男人到底掌握著什麼樣的力量。
螢幕之中，璀璨的結晶樹在一瞬間蔓延鋪張，遮蓋了整個天空。
第六使徒、第七使徒、第九使徒.
能看到那三個使徒的結晶雕塑向外掙脫，它們在陽光下閃著耀眼的光，彷彿完美的藝術品。
S2機關，那並非是一個提供能源的機關，其真正的能源來自狄拉克之海，它本身並不製造能量。
S2機關相當於一個水龍頭，和無窮無盡的大海連線。
伊恩早已瞭解S2機關的本質，他和休眠在負宇宙之中的怪誕蟲直接相連，所以他可以讓原本只能流出涓涓細流的水龍頭釋放出更大的水流！
他在此刻獲得了近乎無限的能量，直接將三個使徒的力場復現。
結晶生長蔓延，一瞬間就將空天使整個包裹起來。
他承受住了空天使的直接衝擊，內部的結晶碎裂，然後又重生，不斷地重複毀滅與新生的過程，將空天使帶來的動能消磨殆盡。
從他獲得S2機關的那個時候，單獨的使徒想和他正面作戰，就已經成為了不可能的事情。
當然，赤木律子等人看不見如此細微的事情。
一切都發生在眨眼之間，遮蔽天空的結晶之海將空天使包裹，隨後在空天使的衝擊下碎裂，紛紛揚揚的碎片，閃爍著光芒，如星辰的碎屑般，飄落大地。
空天使的攻擊被化解了，它彷彿變成了軟綿綿的一坨爛泥從EVA的上方滑落。
“騙人的吧，連這種事情都可以做到嗎？”明日香注視著漫天飛舞的碎光。
這一幕美的夢幻，彷彿她並不在戰場上，而是在一個美好的夢當中。
綾波麗也被眼前的畫面迷住，這樣的視覺體驗絕無僅有，她體會到了“美”這個詞的真正含義。
唯有真嗣的注意力，還專注地集中在使徒上。
軟綿綿的空天使墜落下來，連它的AT立場都被中和掉了，它現在毫無反抗之力。
真嗣推動操縱桿，初號機取出了高振動粒子刀，插入了空天使的眼球內部，那就是空天使的核心。
核心被破壞，空天使內部的能量紊亂，它的體表出現不規則的起伏，像是煮開的沸水那樣冒泡，然後在不穩定的能量波流之中，砰地砸成了碎片。
第十使徒，殲滅！
真嗣這個時候，才有精力，去看這場海市蜃樓般的光雨。
S2機關掉落到了地面，擬態成小型的音樂天使，站在原地。
真嗣看到一個滑翔翼一樣的東西，從天空中劃過，那是伊恩，伊恩在高空和他們揮手，一個人乘著風，自由自在地滑向遠方。
“這算什麼啊，虧本小姐這麼擔心他，他卻玩的這麼開心！”明日香做了一個鬼臉。
“這不是很好嘛？”真嗣懸著的心放了下來：“有機會我也想體驗一下啊，坐滑翔翼的感覺。”
“有的人可是連駕駛EVA都會覺得害怕，那麼高，估計要被嚇尿了吧。”明日香調侃道。
“才才不會呢！”真嗣紅了臉。
緊張的氣氛，緩和了下來，第三東京市又度過了和平的一天。
SEELE，魂之座。
發生在第三新東京市的使徒襲擊影像，被轉移了過來。
老人們有各種手段，得到NERV本部的資料，SEELE的勢力遍佈全球各個領域，他們是從太古時期就存在的秘密結社，SEELE的創始人拾取到了死海文書，從那塊巨大的石板中獲得了“神啟”，在使用火把與石器的時代，引領人類走向文明。