SEELE，魂之座。
老人們，在會議桌前齊聚。
Keel議長的許多器官因為衰老廢棄，被替代成了機械零件，他是SEELE最具權力和話語權的一位，SEELE的總體走向，都是這個老人的意志在把控。
這個秘密結社，就彷彿人類社會的神經，他們的思維，控制著人類社會每一場大事件的發生。
連第二次衝擊，都是他們策劃的。
十五年前，Keel議長，親自和碇源堂抵達了南極，為第一使徒亞當，設定了反AT力場裝置。
在進行接觸實驗的前一天，他和碇源堂離開了實驗基地。
他們早就清楚，和亞當的接觸會引來什麼樣的結果。
當第一使徒醒來的時候，它就會觸發自身的淨化機制，讓這顆星球上的所有生命迴歸最原始的無機物形態。
那並非SEELE想要看到的，所以他們利用反AT力場，讓亞當自爆，引發了第二次衝擊。
“異端逃跑了。”Keel議長對所有人說：“他已經獲得了生命之果。”
SEELE的老人們一時沉默了，這個訊息實在不是個好訊息，從異端爆發的能量波動來看，他能做到的事情超乎SEELE的想象。
他們復原了加持良治刪除的治療室使用記錄，查到了當日的醫療資料，知曉那是個沒有AT力場的“異常存在”。
為了殲滅異端，他們做了許多準備，除了第一支先行部隊後，周圍的軍事力量，他們都能調動。
但是既然對方獲得了生命之果，那麼普通的武器就沒有作用了。
“不管他的目的是什麼，都決不能讓他干擾人類補完計劃！”
“EVA量產機的製作怎麼樣了。”
“已經制作好七臺了，第八臺和第九臺馬上也能完成，只要傀儡控制系統和S2機關完成，就能啟用。”
“使徒的殲滅不能停下，不能為了異端拖累計劃，只能加快補完計劃的進度！”
“還有十位使徒，莉莉絲契約完成之時，便是吾等迴歸福音之時！”
“讓NERV繼續進行計劃，異端就由我們來排除。”
早晨起來的明日香，注視著空無一人的房間。
她來到了隔壁的那間臥室門口，門虛掩著，沒有關，遲疑一下，她推開了門。
床上的被子整齊地疊成了豆腐塊，沒有使用過的痕跡，這是第三天了，伊恩還是沒有回來。
她拿起房間裡的座機打電話，無人接通，給加持先生打電話，也是無人接通。
哪怕問NERV，得到的回答，也只是那兩人在外地出差。
可出差就出差，為什麼不打電話回來呢？上次出差電話都能打通的。
她心裡有種不祥的預感，洗漱完，穿好了衣服，來到隔壁敲門。
“美里姐還沒回來呢，前幾天天還沒亮的時候，她就出去了。”正在洗碗的真嗣回答：“好像有什麼急事”
明日香咬咬牙：“我去NERV看一看！”
“今天不是週三嗎，你不去上學嗎！”真嗣用肥皂洗手。