而彭瑩玉與劉福通本就熟悉，對他關鍵時刻來援，也是心存感念，而此時，他手下的守城兵士，多日浴血征戰，多是傷員殘兵，急需修整，的確難以擔當守城重任，因此也爽快答應。
劉福通兵不血刃已經將濟南城的防務，都控制在了自己的手裡。
下一步便準備藉機清除掉彭瑩玉，徹底控制小明王，奪取整個黃巾軍的領導大權。
那些各部義軍，他不擔心，最讓他絞盡腦汁的反倒是他的同盟軍，肅羽的聞香教。
因為對於肅羽的為人他實在太清楚不過了，到時候，他不但不會支援自己，還會第一個站出來反對自己。
憑藉肅羽此一戰，孤身入脫脫大營，逼迫他退兵，所樹立起來的在義軍中的威望和震懾力，若他反對，自己絕無勝算的可能。
劉福通為此，絞盡腦汁，可是一時又沒有什麼好的辦法。
正在他發愁的時候，羽羅卻匆匆來找他。
原來，羽羅還難捨這一次殺死脫脫的大好機會，但又苦於孤立無援。
因此趕來劉福通處，想讓他出兵幫自己去追殺脫脫。
劉福通心中暗喜，爽快答應。
二人協商好了，聞香教與白蓮會兩路出擊，連夜追擊脫脫大軍。
羽羅自然高興，趕回了聞香教。
劉福通卻並不急著調遣人馬，而是悠哉遊哉地在自己的大帳裡，淺斟小酌，好不快意。
過了一兩個時辰，他才慢悠悠起身。
踏著夜色趕往聞香教駐地。
而此時的肅羽還在自己的大帳裡，絲毫沒有察覺。
劉福通趕來，把羽羅準備偷襲脫脫大軍的事情告知了他，肅羽這才出去查問。
這才發現，羽羅已經瞞著自己率領曲護法所部一千多人，偷偷出了營。
肅羽萬分焦急，只好召集剩下的聞香教眾，匆匆去追趕羽羅他們。
劉福通見他們都離開了，心中釋然。
這才樂滋滋地回自己大營準備。
第二天一早，小明王在彭瑩玉的陪同下，往各部視察問候，結束後，邀請各部首領進入城內，召開慶功大會。
劉福通趁機在大會上，歷數彭瑩玉的指揮失當，致使小明王被困，黃巾軍遭受重創，逼迫彭瑩玉讓出軍權。
彭瑩玉直到這時才看出劉福通的野心，隨即召集人馬率兵抵抗，而劉福通早就做好了一切安排，以平亂之名，把彭瑩玉及其所部近萬人一舉斬殺乾淨。
其餘眾義軍頭領都知道劉福通已經控制了整個濟南，因此，無人敢反對。
在這種情況下，小明王也只好順水推舟，以劉福通平亂有功為由，將整個黃巾軍的軍政大權都一股腦交給了劉福通。
直到此時，肅羽才救出被脫脫大軍圍困的羽羅他們，率領聞香教眾返回濟南城。
當他得知此事，彭瑩玉已死，一切再難迴天。