憑藉著擊殺琛哥的功勞，大蛇建明晉升為新任的暗部部長。他找到志村志誠以前的檔案夾，裡面有宇智波永仁的臥底檔案。
想要徹底了結這件事的大蛇建明，找到宇智波永仁的聯絡方式，希望他回村：我是新任暗部部長，你的臥底生涯已經結束了。
宇智波永仁喜不自勝，喬裝一番後返回木葉，剛想進暗部恢復身份的時候，便發現了大蛇建明的身影。
這個人，他在雷隱暗部的灰色檔案中見過，是臥底，沒想到已經成了木葉的暗部部長。
慌亂的宇智波永仁逃出木葉，他的行為也被大蛇建明發覺。察覺到問題的大蛇建明。找到琛哥生前的秘密據點，找到了那份灰色檔案，裡面確實有自己的資料。
檔案封面上寫著，這是宇智波永仁蒐集到的資料。
看到這裡，木葉觀眾們大氣都不敢出一聲，整部電影高潮迭起無尿點，接下來會發生什麼？宇智波永仁殺死大蛇建明，一切都好起來了？最終結局拍攝時，只有幾個主要演員在場。
宇智波永仁約大蛇建明去天台見面，帶上自己的臥底檔案，他想要恢復身份。大蛇建明燒掉了灰色檔案，又把宇智波永仁的臥底檔案銷燬後，準時赴約。
趕到天台的大蛇建明，一個不查被宇智波永仁使用封印術限制住行動能力。
大蛇建明：“挺利索的。”
宇智波永仁：“我也接受過暗部的專業培訓。”
“呵，你們這些臥底真有意思，老在天台見面。”大蛇建明轉身笑道。
“我不像你，我光明正大。”頓了頓，宇智波永仁接著說：“我要的東西呢？”
大蛇建明：“我要的你都未必帶來。”
“哼，什麼意思，你上來曬太陽的啊？”宇智波永仁不明所以。
“給我個機會。”大蛇建明求生慾望極強，自己現在是暗部部長，他不想放棄這一切。
宇智波永仁問：“怎麼給你機會？”
“我以前沒得選擇，現在我想做一個木葉忍者！”
“好！跟火影說，看他讓不讓你做木葉忍者。”宇智波永仁有自己的堅持，大蛇建明始終是雷隱村的鬼。
“那就是要我死。”
宇智波永仁搖搖頭：“對不起，我是木葉暗部。”
“誰知道？”
檔案已經被銷燬，只要大蛇建明不說，沒有人會知道宇智波永仁是木葉忍者。
場面一度陷入僵局，這時一個木葉暗部突然衝上天台。宇智波永仁解釋自己是木葉的臥底，無果，便挾持大蛇建明想要暫時逃走。
熟料露出一個破綻，被這名木葉暗部當場擊斃。這名暗部，也是琛哥安插過來的鬼。現在琛哥已死，他想投奔大蛇建明，做個真正的木葉忍者。
大蛇建明殺死了這個暗部忍者。
故事的最後，木葉暗部整理過往檔案時，發現了一份絕密檔案，裡面有宇智波永仁的資料，恢復了他的木葉忍者身份，讓他入了木葉烈士園。
大蛇建明只能繼續每天扮演木葉暗部部長的角色，每天兢兢業業，寢食難安。琛哥當初安插了五個臥底，現在算上自己只暴露了四個。
而且，木葉能夠翻出絕密檔案，雷隱村那邊一樣可以，自己隨時有暴露的風險。宇智波永仁得到了解脫，而自己的臥底生涯還要繼續下去，不知哪一天就會暴露。
大蛇建明畢竟是琛哥安插的鬼，哪怕他為木葉兢兢業業做事，也無法抹殺掉他的根底。