2016.5.1集結之園，學社。在修養了大約一個月之後，碇真嗣重新到校上課了，明日香那邊由於透支厲害還得住院療養，霧島真名倒是沒事，但因為那天過於明確地表達了自己的心意,聽說他今天來上學之後，因為太過害羞沒能調整好心態而翹了社團活動，至於
“真希波”，她根本就沒有加入學社。所以，今天的社團教室裡只有碇真嗣和綾波零兩人。
藍髮紅眸的少女坐在窗邊靜靜地看書，這幾乎沒有變化的情景給人一種莫名的安心感，碇真嗣端著自己倒的茶一邊喝一邊想道。
說真的，明明已經抵達了前所未見的世界線,但周圍的環境看起來和之前幾乎沒有什麼區別。
這主要是因為
“第叄次衝擊”發生在
“閉鎖空間”內，對外界的影響微乎其微，而
“夏娃”無法再啟動
“星球生命重塑程式”這種事，根本也無從驗證。同時，光環形狀的第十六使徒在外界只出現了一瞬，幾乎沒有留下影像資料，被當做UFO之類的怪談傳了一陣子，熱度就過去了。
而頂替它的編號的，十二架一組的EVA量產機，由於外形同第六使徒過於相似看起來像一個個長了手腳的魚竟然沒什麼人懷疑。
普通人只會感嘆一下，嗯，NERV又擊敗了一次使徒。碇真嗣不清楚地聯和NERV是怎麼扯皮的，對方持有的觀點似乎是：製造那些量產的EVA只是為了避免把雞蛋裝一個籃子裡，屬於應對NERV可能被使徒打敗的後備計劃，並沒有攻擊NERV並取而代之的意圖。
另外，他們給抓獲的相田劍介扣了個集結之園培養出的，能控制心智的
“超能力特工”的帽子,並指控他潛入軍部重地圖謀不軌。NERV方自然不會認賬：簡直可笑，所謂不軌的圖謀就是控制EVA量產機攻擊自己的大本營是嗎？
如果你們沒有事先安排好攻擊計劃和能快速抵達第叄新東京市的渠道,怎麼會被影響區區幾個人就能順利發動攻擊？
整體的談判局勢，由於地聯那邊確實理虧，又有碇唯在內部挑事，NERV一方非常佔優，最終似乎按著地聯軍部的的腦袋簽了不少大佔便宜的合同，不過這就不是他作為駕駛員能知道的事了。
至於地聯軍方那邊，似乎出於寧死不吃虧的目的，扣下了相田劍介不准他離開，還把轉學手續都辦好了，不用想，那些人一定是看中了他
“可以在別人視線裡消失”的能力，準備培養成特工。至於朋友少了一個的鈴原東二他竟然是
“笨蛋叄人組”裡第一個脫單的，在碇真嗣住院，相田劍介被扣押的這段時間裡，不知怎麼和班長洞木光湊到一起了，每天中午都跑去天台一起吃便當秀恩愛。
要讓碇真嗣猜的話，鈴原櫻小朋友在這段關係裡絕對起到了非常大的促進作用。
也不知道有沒有什麼來促進一下自己碇真嗣又瞄了一眼窗邊的綾波零。
不但沒有促進的,甚至還有阻礙的呢。明明是和自己喜歡的女孩子單獨相處，但心情卻不怎麼激動，主要原因就在於還有第叄者。
資訊統合思念體，由於綾波零特殊的身份，這東西幾乎沒有甩掉的可能，而且，因為它會說話的緣故，也沒辦法當成小貓小狗看待，最麻煩的是，綾波似乎特別信任它，有時候覺得有趣還能直接複述它的話，這就很尷尬了。
“那個，綾波？”不過，無論如何，也不能把難得的獨處時間浪費掉，碇真嗣努力思考一番，終於找到了話題：“你一直保留著記憶的話，這些書不是應該都看過嗎？”
“有些是，”綾波零答道：“有些則會出現新內容。”
“哈？”碇真嗣表示難以理解。
“古典名著基本都不會變化，會出現變化的都是近現代的作品，比如這本名偵探柯南，”綾波零亮了下手上書本的封面：“或許是因為它的故事裡時間也一直沒有推進的緣故，每一次叄衝發生後，它都會多出一些新內容。”
“那還真是神奇，它的作者是不是也能保留記憶？”碇真嗣問道。