在遊戲的過程中，玩家們扮演BIG BOSS在幫手狗子DD以及靜靜，還有後勤部隊的物資支援，甚至改變天氣的等等幫助下，擁有非常流暢的遊戲體驗。
不殺一人的潛入敵人的基地，如同是天神下凡一樣，在物資裝備足夠的出色情況下，肩抗RPG火箭筒，懷揣高爆左輪手槍殺個七進七出。
同時玩家們也可以選擇不使用紙箱，以及迷彩裝置，而是將打暈了的敵人身上的衣服拔下來，妄圖混入其中。
當然你這樣做的前提是得要好好的逼問一下，被你抓住的敵人，從他們口中得到一些關鍵的線索，否則很快你就會被發現。
可隨著遊戲中越來越多的細節，各種隱藏在背後的磁帶故事，以及如電影般極具沉浸感的過場動畫，讓玩家們將關注點慢慢的放到了遊戲上面。
而這也是楊晨想要做到的一點，讓遊戲玩法的樂趣跟劇情的沉浸感共存，當初在《上古卷軸：天際》的時候，借鑑著夢境記憶中的例子，楊晨將遊戲變得更加完整，出色的打擊感跟流暢的動作系統，包括攀爬功能的引入，如果玩家能夠做的到甚至可以從山腳下攀爬到世界之喉上面俯瞰整個天際省。
這些元素在《合金裝備：幻痛》裡面，楊晨同樣加入了進來，甚至要更加的多樣化，各種各樣的載具從普通的馬匹到吉普卡車、坦克、摩托，以及各式各樣的多樣化武器。
這讓《合金裝備：幻痛》擁有了更多的元素，同樣在動作系統上面，楊晨更可能的讓遊戲的操作精簡化。
一款好玩的遊戲，太過於繁瑣是會起到相反作用的。
極具真實的遊戲，比如玩家需要注意自己的在遊戲中的水分、飢餓度、是否冷了，是否熱了，甚至連上廁所都要照顧到，看起來或許會很有意思，但真正上手玩的時候在初期的新鮮感度過後，這種機械式的重複體驗跟繁瑣的操作，絕對是糟糕到爆炸的體驗。
更多的將玩法放在策略的搭配上，比如到底用什麼方法來對抗敵人，又或者用什麼辦法來進行關卡的攻克，同時遊戲中的抓捕敵人計程車兵然後俘虜，看著一排排能力S級評價的基地成員，這會帶來一個很強烈的滿足感。
雖然在任務過程中，這些人都是躲在基地裡面提供後勤，研究裝備什麼的，真正去打生打死賺錢的永遠是他們敬愛的大首領BIG BOSS。
…………
週末坐在家裡的尹正，繼續著之前在上班時候沒有玩完的《合金裝備：幻痛》。
尹正不得不承認這一點，可以說《合金裝備：幻痛》完全就是一個另類，長達數分鐘，甚至是十來分鐘的過場動畫，即便是以講故事為主的RPG遊戲也絕對不會這樣。
但《合金裝備：幻痛》就是這樣做了，只不過在《合金裝備：幻痛》裡面，星雲遊戲也做出了一些妥協，比如玩家可以選擇是否去觀看，而不是完成了一個關卡之後，強制你看個半天。
而整個故事的劇情也足夠讓人去沉迷，只不過有些地方他還是看不太懂，即便在之前他也已經玩過了《合金裝備：原爆點》，甚至將《合金裝備》的漫畫也看了一遍。
隨著骷髏臉的敘述，尹正看到的是一個因為戰爭而失去一切從而厭惡戰爭的人，同時產生出瘋子般的想法，將核武擴散到各個國家，用《合金裝備》作為威懾，讓所有國家彼此忌憚，從而形成了一個和平的世界。
還有那個火人，以及後來飛在天上小孩，跟飛機裡的伊萊以及隱喻當時的合金裝備是被伊萊控制的鏡頭一開始尹正還有點不明白，不過這並不重要。
因為實在是太酷炫了，單刷合金裝備的刺激跟大場面，簡直是讓人有一種爆炸的爽感。
經常刺激的BOSS戰結束之後，尹正看著被鋼筋壓在地上的骷髏臉，以及他懇求著殺掉他的語氣，突然尹正感覺整個人都舒服了，拿起槍跟米勒一起握著槍將地上的骷髏臉的胳膊跟腿打斷，如同曾經米勒遭受過的苦難一樣。
唯一有點讓尹正不爽的是已經決定讓骷髏臉自生自滅後，作為鑽石狗首席科學家的休伊卻因為報復心理而一槍斃了骷髏臉給了他一個痛快。
…………
一般來說銜接《合金裝備：原爆點》，九年的時間過去了，BIG BOSS也成功報仇，並且成立了新的基地鑽石狗，以及擁有了屬於他們自己的核威脅跟合金裝備，故事應該已經結束了。
但之前那如同幽靈一樣的第三子，以及交給到了伊萊手中，世界上唯一一支沒有被毀滅的英語聲帶蟲病毒卻成了伏筆。
隨著左輪山貓對於伊萊的詢問，在第三子的力量下伊萊駕駛著合金裝備叛逃了鑽石狗基地。
而就在這之後基地再一次爆發出了聲帶寄生蟲的危機，而這一次比之前的那一次更強。
密封的基地中，BIG BOSS決定親自前去探查情況，在基地裡面地上的屍體血液，以及紅色的警報燈就如同是地獄一樣。
還有幸存但意識模糊的人，躺在地上發出不明所以的呻吟聲。
一個個的人員死去，曾經玩家們親手回收的高階屬性人員一個個死去，同時左下角不停的跳出英雄值減少的資訊。
“BOSS，讓開，讓我到外面去。”
“我不能死在這個鬼地方！我沒有感染，我沒有感染，對吧！”
一個病房裡面，一個士兵手裡面拿著槍看著走進來的BIG BOSS囈語，坐在電腦前的尹正沒有拔槍，而是控制著BIG BOSS離開了房間。
但他並沒有出來，而是站在原地將手中的槍扔掉。
“如果，我感染了……我不想那樣死掉！”
從腰間拔出手槍，指著自己的太陽穴，一聲槍響。
玩到這裡的時候，尹正的心裡面感到了一陣陣的壓抑。
繼續操縱著BIG BOSS再次朝著前面的路前進，尹正要找到傳遞資訊的那個人。