等到李傕、郭汜等人率軍西歸，抵達陝縣時，才得知牛輔已經死了，眾人群龍無首，失去了依靠，一時間，不知道如何是好，想要各自散去。
最後，李傕派人前往長安，請求朝廷能夠赦免他們，王允以“一年之內，不可兩次大赦天下，”為由，拒絕了李傕等人的要求。
這下，李傕等人更加恐懼，準備丟下軍隊，各自逃走。
就在此時，同在軍中的賈詡說道：“諸位若單騎逃亡，那麼到時候一個亭長就能將你們逮捕。不如我們率軍攻打長安，宣稱為董公報仇。如果成功，就可以掌控朝廷，如果打不下長安，我們再逃亡也不遲。”
李傕等人不過是一時間沒了方向，現在聽了賈詡的話，全都反應過來，眾人歃血為盟，西進長安。
王允得知李傕進軍長安，居然派了涼州豪強出身的楊定等人去找李傕質問。但是，王允又不給他們好臉色。他憤怒的責備楊定等人，說道：“這群從關東回來的鼠輩，到底想幹什麼！你們去給老夫問個究竟。”
楊定等人前往陝縣見到李傕後，將長安虛實盡數告知，更勸李傕進兵。
王允隨即派徐榮領兵討伐李傕，徐榮手下人馬，也有大量涼州人，他們給李傕、郭祀通風報信，徐榮不敵戰死。
至此，李傕合各路涼州人馬，眾達十餘萬之多，將長安團團包圍。
王允令呂布負責守城。郭汜在城北，呂布領兵開門，直奔郭汜，說道：“且卻兵，但身決勝負！”
於是，郭汜、呂布兩人單挑，不過數合，呂布以矛刺傷郭汜手臂，郭汜的護衛騎兵立即上前，救下郭汜，雙方各自罷兵。
長安是堅城，西涼軍一時無法攻克。圍城第八天，呂布軍中的叟兵叛變，開啟城門，引李傕等人攻入城內。
叟兵者，蜀中兵也。
措不及防之下，呂布不敵涼州軍，長安城中大亂，百官多避兵鋒。太常種拂揮劍而出，說道：“我身為國家大臣，不能止戈除暴，致使逆賊攻打皇宮，我還能往哪去！”
最後，種拂力戰而死。
和他一起戰死的，有太僕魯旭、大鴻臚周奐、城門校尉崔烈、越騎校尉王頎等人。
長安城內，吏民遇難者，多達萬餘人。
呂布敗逃之時，駐馬青瑣門外，招呼王允道：“公可以跟我一起走嗎？”
王允道：“若蒙社稷之靈，上安國家，吾之願也。如其不獲，則奉身以死之。朝廷幼少，恃我而已，臨難苟免，吾不忍也。努力謝關東諸公，勤以國家為念。”
見到王允不肯走，呂布只得自己跑了，他率領了數百騎兵，把董卓的人頭系在馬鞍之上，從武關逃出，直奔荊州南陽郡，投奔袁術去了。
李傕、郭汜等人攻入長安城內，親自前往宣平門，將城樓團團圍住。見到天子的儀仗之後，李傕等人下馬，伏地叩頭，然後質問王允，說道：“董太師到底犯了什麼罪，以至於身死族滅？”
王允無奈，走下樓來，反問李傕等人道：“我不曾作威作福，而將軍你卻如此的放縱大膽，舉兵攻打皇城，你們到底想幹什麼！”