朱由榔可是清楚，堵胤錫此次太狠了，朱由榔可不會再放心讓他掌軍了，這種強硬驅使士兵死戰，可一不可二，要不然，這軍心可就散了。
一個月後，朱由榔在全州一一關注著李元胤於清庭的遠作，此時，陳友龍南寧都司已經組編人員也發來朱由榔手上。
朱由榔盯著南寧都司的大小將領名單，片刻後，朱由榔又拿起有關於湖廣江西的情報，金聲恆王得仁已經被清庭搞煩了，他們更是收縮兵力，暗中向社永和示意，是不願開戰的。
看到這些，朱由榔摸了摸客頭：“下旨，令大督府與兵部合議，在全軍調動將領，凡旗隊將領調動不得同在一營，營將以下者，不得在同一衛，營將並營將以上者，不得在同都，凡親軍出任他軍者，視外軍高一級，凡外軍調入親衛者，降級調入。”
丁思良張大張口望著朱由榔，片刻間，丁思良拿出小冊記了下來，丁思良雖然有級大的凝問，但他可不敢開聲。
朱由榔揹著手站於行在窗外：“令大督府與兵部合議，編組軍隊，俱按戚繼光之練兵實紀之法編組，營衛都按何騰蛟之制編組，但保留親軍門衛，凡士兵俱統一編號入冊，見號能知所在之隊伍，一個月凡，朕要看到花名冊，二個月凡，諸軍編組完成。”
說到此時，朱由榔又盯著李元胤送回的訊息：“江西湖廣二地，近期無戰事，令內閣兵部加快，軍政交接，以後，軍隊調動，無皇令不得調，政事，軍隊不得參與，軍隊諸事，俱屬大督府兵部共管，在大督府設一軍法司，專掌軍法審判之職，以後，士兵除犯民事由三司與軍法司共審判外，一切軍事由大督府兵部共管。”
待丁思良記完之後，朱由榔卻揮了揮：“令何騰蛟歸廣州候用，其三衛調贛州由社永和統領，在贛州三衛親軍，回軍廣州候令。”
朱由榔一口氣下完多條命令後，他才鬆了口氣，就在此時，張福祿的聲音卻傳了進來。
“陛下，廣州有密摺傳來。”
“進來吧。”朱由榔皺著眉頭望著門外。
片刻間，張福祿跪於朱由榔面前遞上了一封密摺，朱由榔拿過細看之下，臉色略有不喜。
原來此密摺是有關於船廠有關造船的，但只際記到大福船每艘只能配裝三四十門紅夷大炮。
想到此，是加強型紅夷大炮，朱由榔卻是十分不滿意。
“下令水師編組，按二艘一組十組一隊，三隊一都，暫編一都水師，由陳子壯之弟陳子升任此水師都指揮使，由葉如日任都指揮同知，調袁宗第任都指揮僉事，其下諸將由大督府選調，待朕回到廣州時，朕要看到名單。”
朱由榔說到此時，又想起了什麼，又道：“嚴令船廠造大福船年要造一都大福船出來，所用般料可交由船政局由海外購進。”
“是陛下。”
一個月後，李元胤滿臉興奮地回到全州。
原來，此事，不用李元胤開聲，有許多舊歸降於清庭的大明官員一見耿仲明有機可乘後，他們便如同吃人魚見著血似的，猛得對著耿仲明懟了起來，他們發揮了在大明懟皇帝的威勢。
再加上多爾滾也看耿仲明不順眼，所以這一風波似大有格殺耿仲明之意。
再重要的是，清庭已經令孔有德尚可喜耿仲明領兵回京，湖廣諸地清庭任命之官大有逃棄之舉。
見此，朱由榔鬆了一口氣，他揹著手走了幾步後，雙眼猛得一瞪：“下旨，令章曠令兵隨朕回廣州，由王興守永州，餘龍守全州，其餘諸軍各歸其營，待調任將領。”
“是，陛下。”
而此時，在長沙，耿仲明滿臉死色地躺在房間，他回到長沙後，他想過自殺，想過辭職，他可是清楚，朱由榔送他回來，必定是不安好心的。