這是育種4.0的前置工作。
育種4.0就是應用基因型大資料、表型大資料、環境大資料建立模型,並進行大量計算機模擬,以尋求在全基因組水平上對已知的不同位點等位基因的最佳組合。
它需要兩個大前提,一個是超級計算機的海量算力,第二個就是基因組資料庫。
馬蘭草的算力是有的,基因資料庫是沒有的。
這玩意耗資大,時間久,國內主要做了農作物的基因組測序,還有少量經濟作物。
馬蘭草這種價值低的近似於野草的植物,是沒有做測序的。
所以就得自己來。
文英他們現在就是在準備樣本,然後構建DNA文庫。
接著才是測序。
測序完了還要進行資料預處理、序列比對、變異檢測、功能分析,並將結果視覺化。
複雜著呢。
而接下來DNA文庫構建是最關鍵的一步。
在這個步驟中,會將提取的基因組DNA隨機打斷成小片段,並進行末端修復等等。
育種4.0所需要的全基因組甲基化測序,還需要進行Bisulfite處理。
處理後才可以繪製出全基因組的DNA甲基化圖譜,進而分析甲基化模式與特定表型之間的關聯。
反正就是很麻煩,很耗時,還特殊,只能自己做,涉及到保密嘛。
只有做完了DNA文庫構建,才能把樣本發到其他科研單位一塊做測序那一套工序。
最後拿回來自己做資料分析匯總。
文英她們現在愁的就在這裡,樣本太多。
每個樣本的全基因文庫構建需要幾天到幾周不等。
即便按照一週一個算,一百四十個樣本也要兩年多快三年呢,三個人同時做也要至少一整年。
所以就要有個取捨,哪份先做,哪份後做,如果前面幾個樣本就能達到目的,不是節省了時間嘛。
然後,她們三個意見不統一。
具體有哪些分歧,駱一航沒聽懂,再看羅宏志,一臉懵逼。
反正就是基因組相關,表型表現之類的東西。
誰也說服不了誰不說,她們仨自己的立場還在轉變。
一會兒,文英否了自己的同意秦秋雁,一會兒秦秋雁又同意時娟,再一會兒時娟卻同意文英了。
這事兒鬧得,變成隨機選項了……