柯南也顧不上向小蘭隱瞞了，這個涉及到全日本國防安全的間諜才是重中之重，他飛快地衝出了餐廳，是的，那個間諜X就是勇氣的父親。當那艘海難船出現之後，船長下令發射魚·雷，之後神盾艦劇烈的搖晃，那個時候勇氣是自己一個人，他的父親沒有跟在他身邊，這引起了柯南的第一次注意，而那個人直到大家來到甲板上自由活動之後，才趕來與勇氣匯合，這中間這麼長的時間，足夠他前去艦長室裡面竊取情報了。想到這裡，柯南也終於回想起剛才心中的那一絲違和感來自哪裡，在餐廳裡，那位自稱是勇氣父親的男人給勇氣拿了完整的一份午餐，可是之前在艦尾觀看海鷹直升機升空的時候，勇氣說過他對於牛奶製品之類的食物過敏，那麼他是肯定不能喝牛奶的，可是這位“父親”還是給他拿了一盒牛奶，這個人應該根本就不是勇氣的父親，只是綁架了他來要挾勇氣，陪同自己一起登上神盾艦。
看著柯南跑出了餐廳，小蘭的心裡很不放心，“我有些擔心，我要跟去看看，孩子們就拜託給你了，園子。”
在船艙裡飛奔著的柯南接通了服部平次的電話，“工藤麼？竹川丟棄在先鬥町公園裡的東西像是某種筆記。”
“筆記？”
“對啊，但是整個筆記幾乎都被燒燬了，很難解讀啊……”突然轉角出現了藤井一佐和關口先生，兩位情報保全隊員，柯南趕快用手摁住了手表，躲到了一邊，“聽說竹川從大阪的澱屋橋站下車了……”
看兩人已經走遠了，柯南把手拿開，重新貼到了手錶附近，“服部…服部……你聽到了麼？”
“什麼？”
“竹川好像是去了大阪的澱屋橋站，你們趕快追過去，不能讓他跑了。”
結束通話了電話的柯南來到了甲板上面，他已經發現了勇氣和他的那個“父親”了，避開了那個男人的視線，小聲地呼喚著勇氣的名字，讓他離開那個男人的身邊，防止他成為間諜X的人質。吩咐勇氣去找看守在甲板邊緣的神盾艦船員尋求幫助，柯南獨自來到了那個男人的身邊，“雨宮先生……雨宮先生……雨宮先生……”整整呼喚了三次，那個男人才反應過來。
“哦，是你啊。”他顯然也是對柯南有一定印象的。
“那個，勇氣不要緊吧？”
“對了，勇氣他又跑到哪裡去了？”
“他說他的異位性面板炎發作了，所以先去廁所了。”
“面板炎？”
“像這種病必須要先去廁所把手洗乾淨，才能擦上隨身攜帶的藥，對吧？”
“啊，是啊，所以他去廁所了，我去看看他吧。”
“你在擔心他麼？那麼為什麼當時這艘神盾艦劇烈搖晃的時候，你卻沒有陪在勇氣的身邊？”
“我說過，那個時候我去廁所了……”
“你不是去廁所了，而是去艦長室竊取神盾艦的機密情報了，對吧？我剛剛已經叫了你三聲雨宮先生了，你都沒有反應過來，難道說你這個勇氣的父親和他的姓氏有所不同？另外勇氣身上帶著的藥不是外用藥膏，而是內服的藥劑，因為他得的病不是異位性面板炎，而是食物過敏，而且還是對於牛奶過敏，你竟然還給他拿了一盒牛奶，做父親的，不可能不知道這些事情，也就是說你並不是勇氣的父親，而是某個國家的間諜。”
“你究竟是什麼人？”
“江戶川柯南，是個偵探。”
“哈哈哈哈哈，偵探又如何？憑你一個小鬼頭，又能做些什麼？只要……”話沒說完，X已經把手伸向了柯南，意圖也很明顯，就是要殺人滅口。為了躲避X攻擊的柯南，身體向後傾斜，正準備用腰帶發射出一個足球，來制服這個間諜，卻好巧不巧地踩到了地上散落著的毛利小五郎的名片，摔到了地上。X露出了一個陰險的笑容，這次看你怎麼躲……他的手已經朝著柯南的脖子伸了過來，“小弟弟，你沒事吧？”X才驚覺到甲板上不是隻有他們兩個人存在，周圍已經有很多遊客圍了過來，甚至還有一名海上自衛隊的船員。X看了看場中的情況，此地不可久留，立刻朝著船艙的方向逃跑。