侯寶齋被殺死後，全川的同志軍震驚和憤怒，大家發誓要為南路統領侯寶齋報仇雪恨。
趙爾豐聽到侯寶齋被殺死的訊息後，認為佔領新津的機會來了，急派一支隊伍由雙流彭家場向新津進發。
清軍突破了同志軍北面三合場的防線，佔領了興義場，直逼新津縣城。
在訓練有術的清軍猛烈攻擊下，同志軍雖然奮勇抵抗，前仆後繼，但大刀、長矛、鳥槍和土炮怎麼敵得過清軍的步槍和迫擊炮？
清軍以優勢兵力和武器猛攻，佔領了龍王渡，最終渡過了西河。
用開花炮彈將新津東門城牆轟開了一個大缺口，同志軍奮勇抵抗，傷亡十分慘重。
在東門戰鬥最激烈的時候，清軍放火焚燒民房千餘間，燒死大批同志軍。
趁大火造成的混亂，清軍衝進了城門。
周鴻勳和劉自強不得不下令，趁黑夜暫時撤出新津縣城。
同志軍退到了城郊，周鴻勳令李叫花、妙音、十三妹、王三娘等頭領繼續在郊外的陳港、童子堰等地抗擊清軍，伺機反攻新津縣城。
周鴻勳決定率一部分同志軍去開闢新的根據地，積蓄力量後，再回頭來一舉攻下新津縣城。
他率軍一路攻下洪雅、犍為、嘉定，佔領了富得流油的自流井（即自貢鹽井）。
劉自強則率部攻下彭山、仁壽、眉州、資州等縣，繳獲了大量武器彈藥。
川南同志軍在周洪勳、劉自強、李叫花和妙音等首領的指揮下，在川南和新津縣城郊打了幾個大勝仗。
周洪勳與秦載賡的東路大軍會師後，又回過頭來圍攻新津。
江登選和林梅山趁機率領學生軍“反正”，調轉大炮轟擊清軍陣地。
同志軍經過艱苦卓絕的血戰，大家捨生忘死，英勇戰鬥，終於打退了佔領新津的清軍。
清軍從新津縣城潰敗後，馬飛龍和朱波瀾帶領殘兵全部撤回到成都。
周洪勳、劉自強、李叫花和妙音等首領率領南路大軍，乘勝追殺到成都南門外佈防。
趙爾豐下令各個城門加強防守，不得輕易出城作戰。
各路同志軍加緊攻城，清軍躲在城牆上用火炮瘋狂射擊。
可是，圍城起義軍越打越多，輪番發動攻城戰鬥。
眼看成都危在旦夕，趙爾豐急得像困獸，在鐵籠子裡亂竄。
清廷派去四川戡亂的外省部隊，受到沿線同志軍的阻擊，遲遲不能攻入四川境內。
而朱波瀾的新軍部隊大多是年輕的川人，多數人同情保路運動，不願為趙爾豐賣力，因此趙爾豐認為新軍不可靠。
於是他立即派親信，給鎮守川西的邊務大臣傅榮華去信，急調趙爾豐賴以起家的嫡系部隊——川滇邊防軍來救援成都。
列位看官，川西大山裡哪來的邊防軍？
原來，幾年前一些藏民在英國的挑撥下，將朝廷派出的駐藏幫辦大臣及其隨行人員，在巴塘全部殺害。
清廷隨即任命趙爾豐為駐藏大臣，併兼任川滇邊務大臣。
趙爾豐帶上親信幕僚傅榮華，率領川軍精銳部隊進入藏區平叛。
川軍進入巴塘後，趙爾豐將當地正副土司處死，同時殺死鬧事的藏民數百人。