由於朱波瀾當副都督和十七鎮的鎮統，是趙爾豐簽訂的《四川獨立條約》裡規定的條款，一時還動不了他。
於是，尹昌衡便慫恿川籍軍人向蒲殿俊提出，在新軍十七鎮以外，再增擴一個鎮的軍隊建制。
由尹昌衡兼任鎮統，以安定心懷不滿的川籍軍人。
尹昌衡希望真正抓到軍權，可以尋找機會，隨時趕走朱波瀾，由自己來擔任統管軍隊的副都督，甚至直接擔任都督。
可是蒲殿俊和朱波瀾商量後，對尹昌衡的企圖有所防備。
蒲殿俊以兵員和餉械尚需籌備，只能在以後逐步解決為由，拒絕了增擴一鎮新軍的請求。
於是，尹昌衡大發脾氣，帶了幾個川籍軍官來到參謀部，親自向方濤部長提出增擴一個鎮的問題。
方部長不答話，做出嗤之以鼻的樣子。
尹昌衡大怒，破口大罵方濤，斥責他瞧不起四川人。與尹昌衡同來的川籍軍官，也跟著群起咆哮怒罵。
一個軍官拔槍出來，要打死方濤，嚇得方濤趕緊抱頭鼠竄。
這時，川籍標統周駿拔出指揮刀，大罵道：“狗日的方濤，不把四川的軍官當人看啦！”
一刀砍下去，將參謀部的辦公桌斬掉了一隻角。
尹昌衡等人大鬧軍政府後，參謀部的正副部長，都嚇得不敢來上班。
尹昌衡大力拉攏四川籍軍官，頻繁串聯，密謀奪取總督府的官位和權力。
同時，尹昌衡利用自己的袍哥身份，與同志軍中的袍哥首領稱兄道弟。他還加緊聯絡各地的袍哥，準備大幹一場。
多數袍哥首領認為自己保路有功，希望尹昌衡能為他們這些功臣，在軍政府裡謀個好官職噹噹。
尹昌衡和同學周駿密謀，為川籍軍人到處要官職，爭著在軍政府裡安插自己人，同時排擠外省人。
他向蒲殿俊提出：“軍政府中三科十部，不得任用外省人。”外省籍軍人聽到後，十分恐懼，人人自危。
朱波瀾發現尹昌衡這是衝著自己來的，目的是要趕走自己，然後取而代之。
他馬上召集客籍軍官商議對策，組織起“十七省旅川同鄉救亡會”，透過抱團來對抗尹昌衡。
尹昌衡等人把軍政府鬧得一團糟，把蒲殿俊和羅綸這幫文人弄得焦頭爛額、驚慌失措。
他們不知怎樣對付這幫軍人，忙召集一些官員密秘商議對策。
有人質問蒲殿俊：“為什麼會讓軍權盡落他人之手，都督完全不能控制軍隊？”
蒲殿俊無奈地答道：“獨立條約裡規定是這個樣子，我有啥子法嘛！”
多數人提出：“現在政府的軍隊，實際上仍然受到趙爾豐的暗中控制，都督根本指揮不動軍隊。
因此，軍政府要儘快把趙爾豐趕出總督府，逼他離開成都去川西赴任，斬斷他控制軍隊的黑手。”
羅綸向蒲殿俊建議：
“都督要儘量拉攏利用同志軍，把劉英俊、廖春雷等人領導的部隊，改編成軍政府自己的武裝，才能牽制住朱波瀾和尹昌衡，分散他們掌握的軍權。”
卻說趙爾豐卸任四川總督後，按照和談協議，他仍然擔任清廷“川滇邊務大臣”的職務，應該立即去川西統領大山中的邊防軍。