在地底怪獸滅絕計劃展開的同時，高山我夢聯絡到了高斯，並將地底怪獸滅絕計劃告訴高斯，想讓高斯帶著這些地底怪獸離開地球，避免與人類發生衝突。
高斯答應了，並叫來麥克斯和戴拿幫助他。
高山我夢當即通知XIG的總指揮，告訴總指揮這個計劃。
總指揮又立即上報給地球聯合組織，聲稱蓋亞奧特曼想把地底怪獸轉移出地球，希望人類能退後一步，不要實施地底怪獸滅絕計劃。
地球聯合組織經過商議，決定尊重蓋亞的計劃，但是如果蓋亞的計劃失敗，他們仍然會啟動地底怪獸滅絕計劃。
另一邊，蓋亞等四個巨人也馬上行動裡起來，他們以人類大小的奧特曼狀態潛入地底，尋找地底怪獸，希望把地底怪獸帶出地球。
他們找到的第一隻地底怪獸是甲殼怪獸莊尼路，背上長著三角形的甲殼，甲殼裡面在進行核聚變反應，只要開啟甲殼，裡面的核反應能量就會爆發出來，威力足以媲美氫彈。
蓋亞一行人喚醒甲殼怪獸，由高斯對它進行勸說。
然而事情卻並沒有他們想象中的那麼順利，甲殼怪獸因為被吵醒，有起床氣，哪管前面的是誰，直接上去對，高斯甚至連滿月光波都沒有發出就被撞飛了。
接著甲殼怪獸爬出地面，它出現的位置距離市區剛好只有一公里左右。
四個奧特曼急忙出現在怪獸周身，憤怒的怪獸開啟背後的甲殼，核聚變產生的巨大能量爆發了出來，幸虧四個巨人及時展開屏障，把核反應的能量鎖定在以怪獸為中心的一百米範圍之內。
巨大的爆炸沒有波及市區，但是倒是把甲殼怪獸本身炸死了。
“……”
“……”
“……”
“……”
望著怪獸的殘軀，無論巨人還是人類，皆是沉默以對。
這是個意外，巨人並沒有因此放棄，他們繼續去尋找怪獸，這一回他們找到了地底岩漿怪獸，這一回他們透過深入淺出的方式，可算是沒有讓岩漿怪獸發飆。
只不過，岩漿怪獸表示並不想離開地球。
奧特曼們為了不讓人類把怪獸趕盡殺絕，想把怪獸移到地球外，但是卻忘了怪獸本身的意志，同樣是地球原生的生命，地球就是它們的家，它們不想離開家，沒有人有權力讓它們離開。
一次又一次的失敗，終於接觸到了人類的忍耐極限。
地底怪獸滅絕計劃，還是開始了！
修復後的光量子計算機克利西斯計算出怪獸的方位，人類在怪獸頭頂上安裝鑽地導彈，半天施工之後，全球有五十多個地方把鑽地導彈安裝完畢，畢竟這是動用了全人類之力，效率非常高。
隨後，鑽地導彈發射！
一顆顆破壞力巨大的鑽地導彈進入地下，讓沉睡的怪獸進入永眠。
但是，有一點是所有人都沒有想到的。
地底下，除了怪獸，還有另一種生物，或者說另一種文明——地底人類。
地底人類與地底怪獸通常情況下是和平共處的關係，地上人類為了消滅地底怪獸，把麥格斯動力系統裝入鑽地導彈裡，爆炸之後釋放出來的光粒子對地底人類是致命的，就像核輻射對地上人類的危害一樣。
因為這一次全球性攻擊地底怪獸，地底人類也遭到了近乎滅絕的打擊。
“巴薩庫系統啟動！消滅地上人類！”