在方正忙於爆兵升級的同時，埃洛伊和少女們也繼續在追蹤那試圖喚醒毀滅世界的機器的暗影卡加族。而且，她們也傳回來了不少訊息。
比如說，她們發現了幕後控制暗影卡加族的，是一個名為哈迪斯的人工AI，而這個AI正是蓋亞系統的子程式之一，和赫菲斯托斯一樣。
不僅如此，她們還了解了關於埃洛伊的身世，她是創造蓋亞系統的伊麗莎白博士的克隆人，之前蓋亞系統遭到攻擊，所有子程式全部自動斷線之後，為了確保計劃能夠順利進行下去，蓋亞系統便利用了最後剩下的資料創造了埃洛伊這個克隆人嬰兒，將其放在外面交給諾拉族撫養。畢竟伊麗莎白博士是整個零之曙光計劃的核心人物，所以埃洛伊才能夠自由出入其他被封閉的設施———因為按照許可權來說，繼承了伊麗莎白基因的埃洛伊顯然是最高的。
而她們也終於發現了零之曙光的真相。
那就是………重生。
人類的毀滅已經不可避免，因此為了讓人類一族延續下去，伊麗莎白博士提出了“零之曙光”計劃，那就是將人類的基因冷凍，儲存下來，然後在適當的時候再將它們重新喚醒。
簡單來說就是，所有人都死光了，然後只能夠坐等那些機械軍團自我毀滅，等它們毀滅之後，蓋亞系統再重新改造地球，讓那個已經被機械軍團吞噬殆盡，化為焦土的星球重新恢復生機與活力。接著再利用基因克隆創造出嬰兒，教授他們關於地球和人類歷史的知識，最後延續人類文明。
在將此事報告給方正時，埃洛伊感慨不已，但是方正的反應卻是………
“這什麼智障計劃？”
一面對眼前的藍圖進行修改，方正一面無語的望著旁邊埃洛伊的全息影像。
“說真的，避難所都比這靠譜………他們怎麼會想到這麼愚蠢的玩意兒？真是無法理解。”
“很………愚蠢嗎？”
“至少在我看來很愚蠢，算了，反正已經這樣了，現在再批判前人也沒什麼意義。”
方正無奈的搖了搖頭，他是真的不理解，為什麼伊麗莎白會採取這樣一個計劃。退一萬步來說，就算機械軍團真的摧毀了地表的一切，但是人類還是可以在地下生活啊。以他們的科技文明實力，創造出類似避難所的地下封閉城市並不是什麼困難的事情。當然，方正並不是說零之曙光計劃不好，但是在他看來，這個計劃說白了也就適合做一個備份的備份，說白了就是在最後關頭才應該使用的計劃。
結果這些人居然直接拿零之曙光計劃作為核心？甚至不惜為此讓大量平民犧牲？
搞笑吧，不想著如何延續現在，就想著怎麼面向未來了？
算了，以美國人的智商程度和歷史水平，估計他們也很難理解歷史文明的延續性是個什麼東西。
再考慮到他們當初就是這麼滅掉印第安人的………嗯，可以理解。
畢竟賊也只會考慮賊的辦法，強盜也只會考慮強盜的辦法。
“所以，你聯絡我是打算告訴我這個無聊的事情嗎？”
“不，其實………是綺凜小姐她們圍繞這件事吵起來了………”
“……………哈啊？閒的？”
聽到這裡，方正愣了一下，接著埃洛伊也對他說明了事情的前因後果。
原來，就在不久之前，埃洛伊她們來到了零之曙光的核心設施裡，然而在這裡，她們卻發現了一個秘密。
那就是………零之曙光計劃的核心成員全部都死了，而且是被殺死的！
不僅如此，在看了記錄之後，少女們才得知，有人反對這個計劃，他正是法羅公司的總裁，也是零之曙光計劃的出資人，泰德.法羅。
他認為讓新一代人類獲得那些知識是危險又愚蠢的行為，因此他使用自己的許可權，清空了子系統阿波羅之後所有關於人類的知識，按照他的說法，這是為了讓那些日後出現的新人類沒有枷鎖，能夠自由自在的全新開始，而不是揹負著祖先的罪孽………也因此他殺死了其他的核心成員。
對此，少女們也是看法不一，有人覺得這樣也挺好的，但是有人卻覺得這根本就是背棄歷史，忘記過去。而且，要不是那個叫泰德法羅的傢伙清空了人類知識庫的話，現在這些人類也不至於像原始部落一樣生活！
雙方都覺得自己有道理，但是都說服不了對方，最終無奈之下只有放大招了。
找老師………不對，找方正評理。