幕府的建立，意味著武士階層的崛起，但同時也意味著國家的分裂，從此倭國失去了統一的稅收、財政和軍隊。
幕府的建立者們對這一點非常清楚，但他們並不反對。
鎌倉幕府的財政情況雖然好於室町幕府，但遠不如德川幕府，其經濟來源主要有三個：
一、“關東御領”，即朝廷賞賜給源賴朝個人的五百多處莊園；
二、“關東御分國”，指朝廷把伊豆、相模、上總、信濃、越後、駿河、武藏、下總八國的國司任免權下發給源賴朝，可由幕府推薦御家人擔任，並可由幕府直接解職；
三、“關東進止所領”，這是源賴朝的岳父北條時政爭取來的，幕府可在很多莊園和公領中設定地頭的權力。
從這裡可以看出，鎌倉幕府的經濟基礎是如何的薄弱了，它控制的封國都在關東，經濟基礎較差，而且數量太少，只有八個，而九州一島的封國就有九個之多。
所以鎌倉幕府是在玩著一個以小博大的遊戲，它是在用很小的力量、大義的名分控制著一個國家，武士們對幕府的支援，只是因為幕府能夠保護、維持他們的利益，僅此而已。
而後世的德川幕府則要強大許多，德川幕府控制全國四分之一的糧食產區，控制著金銀銅的鑄幣權，還控制著大阪、京都、江都等重要城市，所以其統治基礎是非常穩固的。
不僅如此，地處關東的德川幕府還採取了閉關鎖國政策，徹底斷絕了西部封國透過貿易增強實力的途徑，最大化的消除了不穩定因素。
所以，經濟實力薄弱的鎌倉幕府，在外來力量的侵襲下，不堪一擊。
元朝，對於倭國來說，是個難以想象的龐然大物，但倭國卻決定不惜一戰，這是倭國的風骨，也是鎌倉幕府的喪鐘。
從至元五年，元世祖忽必烈派使者前往倭國，到至元二十三年，元世祖放棄徵倭為止，這十六年的時間裡，倭國雖然擊敗了元軍的兩次入侵，卻背上了沉重的財政負擔，無論是戰前編組、工事修築、戰爭損失、戰後犒賞，以及長期的枕戈待旦，都大量的耗費了這個倭國的資源。
但是，鎌倉幕府作為全國的統治者，不得不負擔起填補這個窟窿的重任，只可惜，幕府的力量沒有那麼大。
與元軍奮戰最英勇的、損失最慘重的，都是幕府的親信——御家人，是幕府的中流砥柱，但幕府不僅無力對其進行犒賞，甚至連對其戰損進行補充都無法做到，這深深動搖了幕府的統治基礎。
這些忠心的御家人陷入困境，部分人困苦不堪，不得不向高利貸者借貸，進而失去了土地、財富，另一部分人則鋌而走險，蠶食公家土地，填補虧空，幕府不敢阻止，久而久之，這兩部分人都不再忠心於幕府，幕府的根基從此開始動搖。
對於幕府的困境，皇室看在眼裡，熱在心頭，後醍醐天皇決定“倒幕”，經過一系列的戰爭，鎌倉幕府滅亡，後醍醐天皇重新確立了天皇獨裁製度。
只可惜這個時間太短暫了，第二年，足利尊氏就反叛了，第三年，足利尊氏成立幕府，也就是室町幕府。
一般來說，世人都有畏難情緒，但是有些人偏偏喜歡迎難而上，因為他們知道，困難越大，最終解決後，收益也越大。
鎌倉幕府，或者說源賴朝，面對是把持大半個國家的平家，所以擊敗平家之後，平家豐厚的遺產都是他的戰利品，他可以將自己的心腹安插到全國，從而建立自己的武家政權。
但是室町幕府則不同，其對手是一心倒幕的皇室及其少量爪牙，還有一些意見不同的同族，擊敗這些人，對幕府的經濟、軍事實力的補益可以說微乎其微。
為了迅速結束戰爭，室町幕府不得不對各地的大名進行妥協，因此在對各地大名的控制上，室町幕府遠不如鎌倉幕府，所以，室町幕府本質上是各地強力大名的聯合政權，這些已經從鎌倉幕府那裡獲得了土地、財產的大名們，並沒有對室町幕府感恩戴德，只是承認其權威而已。
所以幕府將軍並沒有絕對的權威，而足利義教的慘死，就在於其想樹立將軍的權威，只可惜他失敗了，死了！
室町幕府著名的三管領分別是斯波氏、細川氏和畠山氏，他們都是足利氏的同族，也是足利家族的同盟者，其中細川氏控制四國、近京畿的土地，畠山氏控制關東中部的土地，斯波氏控制關東東部的土地，而幕府直轄的領地非常少，只有分散於各地約兩百餘處的直轄地“御料所”；同時在畿內的交通要道設定“關所”，徵收關錢；除此之外還有一些雜稅。
正因為財政的匱乏，足利義滿非常希望和明國保持良好的關係，透過與明國的貿易來增加收入，為此不惜嚮明國稱臣，但是反對者甚多，足利義持、斯波義將是其中的佼佼者，細川賴元和畠山滿家等人，則保持觀望態度。
對於其中的原因，足利義滿心知肚明，這些同族並不希望足利家過於強大，他們更希望保持現狀，這一點，足利義滿能夠理解，但卻不可能接受，只可惜長子足利義持如同被洗了腦一般，一口一個“吾國從未臣服於人”，根本聽不進去自己的話。
所以，足利義滿將足利義持和斯波義將派往九州，讓他們直面明國的兵峰。這樣做有兩個好處：如果明軍勢大，那麼親歷對明戰爭的他們，自然會變得服服帖帖，乖乖與明國議和；如果明軍勢弱，那也容易，足利義滿打算以防備明軍再次入寇的理由，將他們留在那裡，方便自己安排。
至於二人擁兵自重，足利義滿並不擔心，雖然澀川滿賴與斯波義將關係不錯，但是澀川滿賴更忠於自己，且在九州威望不高；而前任探題今川貞世在九州威望甚高，且與斯波義將極為不和，所以足利義滿相信，他們兩個人翻不了天。
但是，戰局的發展大大出乎義滿的意料，九州守軍不堪一擊，明軍迅速平定九州，以勇悍的島津家族幾乎全滅，前往督戰的足利義持被俘，斯波義將戰死，這不由得讓足利義滿懷疑，自己是不是有些託大了，甚至他懷疑是不是有人暗中投降了明軍，為其帶路？
所以斯波義重願意出使明國，足利義滿立刻就同意了，在他看來，斯波義重只要去了，那麼只要看明國的接待方式，就能夠看出許多東西。
如果斯波義重受到明國熱烈接待，那麼就可以繼續談，只要不要自己去明國領罪，那麼什麼都可以談，對於赤松義則的罪責，足利義滿已經想好了人選，後小松天皇很適合背這個鍋，自己可以將其廢黜，送往明國，然後再立一個天皇，對外改稱國王即可，至於國內的“國”，改為“州”，也沒什麼不好。
但是，斯波義重竟然和明軍發生了衝突，斯波義重被擒，明軍趁機攻陷了下關。這讓足利義滿有些措手不及，甚至讓他開始懷疑明國是不是根本沒有談判的想法，非要自己剖腹謝罪才肯罷休。
但足利義滿沒有盲動，他先召集了手下討論對策，發現大家眾說紛紜，但主戰的居多，無奈之下，足利義滿又去了皇宮，出乎他的意料，後小松天皇對明國要求足利義滿前往謝罪的詔書憤慨至極，同意全國動員，對明宣戰。
之後皇宮、幕府先後釋出了動員令，全國各大名紛紛動員起來，關東的武士紛紛西調，增援京都一線。
但是，足利義滿並沒有向長門、周防增兵，而是採取了誘敵深入、層層阻擊、堅壁清野的戰略，關西的長門、周防、石見、出雲、安芸、備中、備後等等地區，老弱、糧食紛紛東調，同時足利義滿還向西派出小股精銳武士，意圖襲擊明軍補給線，逐步消磨明軍銳氣，然後在京都附近與明軍決戰。
事情安排下去之後，足利義滿並沒有安心，不安的感覺反而更加強烈。
為了增強幕府本部的力量，以斯波家裡通明國的名義，沒收斯波家的領地，這些領地大部分被歸入幕府直轄，少部分歸入畠山、細川兩家，至於其他大名的戒懼、畠山和細川兩家的防備，足利義滿已經顧不上了。
同時足利義滿啟動了“櫻花”，令其對內外重臣進行監視，其中皇宮、畠山家、細川家是重中之重，而澀川滿賴是足利義滿想要重用的人，但首先，足利義滿要確認他是真的可靠才行！